MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-8 DNA

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020828	TA	3	6	1867	1872	50 %	50 %	0 %	0 %	472279774
2	NC_020828	T	7	7	1974	1980	0 %	100 %	0 %	0 %	472279774
3	NC_020828	ATT	2	6	1983	1988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279774
4	NC_020828	AAC	2	6	2035	2040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279774
5	NC_020828	AAT	2	6	2073	2078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279774
6	NC_020828	GAT	2	6	2088	2093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279774
7	NC_020828	GTA	2	6	2140	2145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279774
8	NC_020828	TGTT	2	8	2167	2174	0 %	75 %	25 %	0 %	472279774
9	NC_020828	TTG	2	6	2194	2199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279774
10	NC_020828	TA	3	6	2217	2222	50 %	50 %	0 %	0 %	472279774
11	NC_020828	TA	3	6	2233	2238	50 %	50 %	0 %	0 %	472279774
12	NC_020828	CTT	2	6	2253	2258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279774
13	NC_020828	AAT	2	6	2259	2264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279774
14	NC_020828	AAC	2	6	2357	2362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279774
15	NC_020828	T	6	6	2372	2377	0 %	100 %	0 %	0 %	472279774
16	NC_020828	AGA	2	6	2384	2389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279774
17	NC_020828	T	7	7	2390	2396	0 %	100 %	0 %	0 %	472279774
18	NC_020828	A	6	6	2427	2432	100 %	0 %	0 %	0 %	472279774
19	NC_020828	GATA	2	8	2445	2452	50 %	25 %	25 %	0 %	472279774
20	NC_020828	AGA	2	6	2471	2476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279774
21	NC_020828	A	7	7	2510	2516	100 %	0 %	0 %	0 %	472279774
22	NC_020828	AAAG	2	8	2573	2580	75 %	0 %	25 %	0 %	472279774
23	NC_020828	AACAG	2	10	2657	2666	60 %	0 %	20 %	20 %	472279774
24	NC_020828	GC	3	6	2675	2680	0 %	0 %	50 %	50 %	472279774
25	NC_020828	A	7	7	2757	2763	100 %	0 %	0 %	0 %	472279774
26	NC_020828	AAG	2	6	2782	2787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279774
27	NC_020828	TGA	2	6	2847	2852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279775
28	NC_020828	AAAC	2	8	2866	2873	75 %	0 %	0 %	25 %	472279775
29	NC_020828	CAA	2	6	3004	3009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279775
30	NC_020828	A	6	6	3019	3024	100 %	0 %	0 %	0 %	472279775
31	NC_020828	CAA	2	6	3036	3041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279775
32	NC_020828	AAT	2	6	3046	3051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279775
33	NC_020828	AAG	2	6	3069	3074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279775
34	NC_020828	ACAA	2	8	3104	3111	75 %	0 %	0 %	25 %	472279775
35	NC_020828	TAC	2	6	3114	3119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279775
36	NC_020828	CAA	2	6	3127	3132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279775
37	NC_020828	CAA	3	9	3163	3171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279775
38	NC_020828	AAC	2	6	3180	3185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279775
39	NC_020828	AGA	2	6	3189	3194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279775
40	NC_020828	AG	3	6	3199	3204	50 %	0 %	50 %	0 %	472279775
41	NC_020828	A	6	6	3221	3226	100 %	0 %	0 %	0 %	472279775
42	NC_020828	AGA	2	6	3282	3287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279775
43	NC_020828	ATAAAA	2	12	3296	3307	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	472279775
44	NC_020828	TGG	2	6	3319	3324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279775
45	NC_020828	GAT	2	6	3685	3690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279776
46	NC_020828	A	6	6	3698	3703	100 %	0 %	0 %	0 %	472279776
47	NC_020828	TGA	2	6	3709	3714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279776
48	NC_020828	TAATTG	2	12	3777	3788	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	472279776
49	NC_020828	T	6	6	3854	3859	0 %	100 %	0 %	0 %	472279776
50	NC_020828	TAT	2	6	3943	3948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279776
51	NC_020828	ATT	3	9	4021	4029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279776
52	NC_020828	CATT	2	8	4047	4054	25 %	50 %	0 %	25 %	472279776
53	NC_020828	TAC	2	6	4967	4972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279777
54	NC_020828	GA	3	6	4982	4987	50 %	0 %	50 %	0 %	472279777
55	NC_020828	T	7	7	5062	5068	0 %	100 %	0 %	0 %	472279777
56	NC_020828	GTG	2	6	5076	5081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279777
57	NC_020828	T	6	6	5086	5091	0 %	100 %	0 %	0 %	472279777
58	NC_020828	T	6	6	5104	5109	0 %	100 %	0 %	0 %	472279777
59	NC_020828	CAA	2	6	5232	5237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279777
60	NC_020828	A	6	6	5239	5244	100 %	0 %	0 %	0 %	472279777
61	NC_020828	AT	3	6	5259	5264	50 %	50 %	0 %	0 %	472279777
62	NC_020828	T	6	6	5272	5277	0 %	100 %	0 %	0 %	472279777
63	NC_020828	TAG	2	6	5280	5285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279777
64	NC_020828	T	7	7	5323	5329	0 %	100 %	0 %	0 %	472279777
65	NC_020828	T	6	6	5334	5339	0 %	100 %	0 %	0 %	472279777
66	NC_020828	T	8	8	5341	5348	0 %	100 %	0 %	0 %	472279777
67	NC_020828	AGTAAA	3	18	5381	5398	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	472279777
68	NC_020828	A	9	9	5681	5689	100 %	0 %	0 %	0 %	472279778
69	NC_020828	TGC	2	6	5734	5739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279778
70	NC_020828	TCA	2	6	5767	5772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279778
71	NC_020828	AGC	2	6	5789	5794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279778
72	NC_020828	AACA	2	8	5808	5815	75 %	0 %	0 %	25 %	472279778
73	NC_020828	AGT	2	6	5816	5821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279778
74	NC_020828	A	8	8	5822	5829	100 %	0 %	0 %	0 %	472279778
75	NC_020828	CTT	2	6	5847	5852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279778
76	NC_020828	AGT	2	6	5861	5866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279778
77	NC_020828	CTA	2	6	5886	5891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279778
78	NC_020828	CTA	2	6	5895	5900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279778
79	NC_020828	CAA	2	6	5903	5908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279778
80	NC_020828	TTC	2	6	5914	5919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279778
81	NC_020828	AGT	2	6	5930	5935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279778
82	NC_020828	CAG	2	6	5946	5951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279778
83	NC_020828	TAC	2	6	5962	5967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279778
84	NC_020828	TCAA	2	8	6117	6124	50 %	25 %	0 %	25 %	472279778
85	NC_020828	TAAAA	2	10	6146	6155	80 %	20 %	0 %	0 %	472279778
86	NC_020828	T	6	6	6366	6371	0 %	100 %	0 %	0 %	472279779
87	NC_020828	TCT	2	6	6376	6381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279779
88	NC_020828	ATTCTA	2	12	6449	6460	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	472279779
89	NC_020828	T	6	6	6636	6641	0 %	100 %	0 %	0 %	472279779
90	NC_020828	ATC	2	6	6657	6662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279779
91	NC_020828	ATA	2	6	6663	6668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279779
92	NC_020828	T	6	6	6710	6715	0 %	100 %	0 %	0 %	472279779
93	NC_020828	CCAA	2	8	6716	6723	50 %	0 %	0 %	50 %	472279779
94	NC_020828	TTC	2	6	6766	6771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279779
95	NC_020828	ATTT	2	8	6828	6835	25 %	75 %	0 %	0 %	472279779
96	NC_020828	TTA	2	6	6856	6861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279779
97	NC_020828	TCT	2	6	7003	7008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279779
98	NC_020828	T	6	6	7008	7013	0 %	100 %	0 %	0 %	472279779
99	NC_020828	T	6	6	7017	7022	0 %	100 %	0 %	0 %	472279779
100	NC_020828	TGT	2	6	7041	7046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279779
101	NC_020828	ATC	2	6	7065	7070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279779
102	NC_020828	ATC	2	6	7074	7079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279779
103	NC_020828	A	6	6	7082	7087	100 %	0 %	0 %	0 %	472279779
104	NC_020828	ACT	2	6	7098	7103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279779
105	NC_020828	AT	3	6	7105	7110	50 %	50 %	0 %	0 %	472279779
106	NC_020828	TCATT	2	10	7148	7157	20 %	60 %	0 %	20 %	472279779
107	NC_020828	ATA	2	6	7171	7176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279779
108	NC_020828	A	7	7	7239	7245	100 %	0 %	0 %	0 %	472279779
109	NC_020828	ATC	2	6	7260	7265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279779
110	NC_020828	TA	3	6	7316	7321	50 %	50 %	0 %	0 %	472279779
111	NC_020828	ATTC	2	8	7344	7351	25 %	50 %	0 %	25 %	472279779

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.